Eine TYPO3-Installation besteht aus zwei Teilen: der Datenbank und den Dateien im Dateisystem. Um ein vollständig reproduzierbares Abbild der Installation zu erzeugen, müssen beide Bereiche gesichert werden. Damit die Daten vollständig gesichert werden können, wird hier die Organisation der Dateien einer TYPO3-Installation anhand eines Beispiels erläutert. Das folgende Tabelle listet die Dateien einer möglichen TYPO3-Installation auf:
| Dateiname | Typ | Linkziel |
| clear.gif | Datei | |
| fileadmin | Verzeichnis | |
| index.php | Softlink | tslib/index_ts.php |
| media | Softlink | tslib/media |
| showpic.php | Softlink | tslib/showpic.php |
| t3lib | Softlink | typo3_src/t3lib |
| tslib | Softlink | typo3/sysext/cms/tslib |
| typo3 | Softlink | typo3_src/typo3 |
| typo3_src | Softlink | typo3_src-4.0 |
| typo3_src-4.0 | Verzeichnis | |
| typo3conf | Verzeichnis | |
| typo3temp | Verzeichnis | |
| uploads | Verzeichnis |
Die Besonderheit an dieser Struktur ist, dass mit Softlinks gearbeitet wird (nur unter Unix/Linux möglich), die ein späteres Update der TYPO3-Installation deutlich erleichtern. Es muss dann nur der „typo3_src-x.x.x“ Ordner hinzugefügt werden und der Link „typo3_src“ auf das neu erstellte Verzeichnis „typo3_src-x.x.x“ umgestellt werden.
| Die notwendigen Dateien befinden sich in folgenden Verzeichnissen: |
| fileadmin: Dateien, die Benutzer mit Zugang zur Dateiliste auf den Server kopiert haben. |
| typo3conf: Die Konfigurationen der TYPO3-Installation und lokal installierte Extensions. |
| uploads: Diverse von Benutzern (Backend und Frontend) hochgeladene Dateien. |
| typo3_src-x.x.x: TYPO3 Source-Verzeichnis |
Bei mehreren vorhandenen TYPO3-Sourcen kann die zurzeit aktive ermittelt werden, indem abgelesen wird, auf welches Verzeichnis der Link „typo3_src“ verweist.
